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目的
建立一种可同时检测禽流感病毒H9N2的HA和NA基因一步法双重荧光RT-PCR方法。
方法针对H9N2禽流感病毒的HA和NA基因保守区,设计相应的特异性引物以及探针,优化检测体系及反应条件,建立一步法双重荧光定量RT-PCR方法。对该方法的灵敏度、特异性、稳定性进行验证与评估,并对家禽粪便标本进行应用检测,以单重实时荧光RT-PCR方法作为参照,检测结果不一致的样本采用测序进行验证。
结果该方法特异性强,与H1、H3、H5、H7亚型禽流感病毒、鸡新城疫及鸡传染性支炎病毒均无交叉反应,对HA和NA基因的最低检出限分别可达50拷贝/μL和25拷贝/μL,组间与组内的变异系数在0.20~0.79%之间。对82份粪便标本进行检测,H9N2禽流感病毒的阳性率为8.14%(7/82),与单重实时荧光RT-PCR法检测结果一致。
结论该方法特异性强、灵敏度高、稳定性好,可应用于临床禽流感样本的检测。