【摘 要】
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黄麻是世界上重要的天然韧皮部纤维作物之一。然而, SSR 标记的缺乏限制了黄麻的遗传改良。本研究从圆果种黄麻测序品种CVL^-1 的基因组、基因、CDS 和cDNA中挖掘SSR 信息,
【机 构】
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福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/福建省作物设计育种重点实验室/作物科学学院,福建农林大学海峡联合研究院基因组与生物技术中心
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(31771369);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-19-E06);农业部东南黄红麻实验观测站(农科教发2011);福建省麻类种质资源共享平台(2010N2002)资助~~
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黄麻是世界上重要的天然韧皮部纤维作物之一。然而, SSR 标记的缺乏限制了黄麻的遗传改良。本研究从圆果种黄麻测序品种CVL^-1 的基因组、基因、CDS 和cDNA中挖掘SSR 信息, 利用SSR Primer 软件查找SSR 位点, 并分析其分布特征。结果表明, 基于基因组序列共开发了153,242个基因组SSR, 平均密度为467.20 个SSR Mb^–1; 基于cDNA 序列开发了10,747个SSR, 平均密度为260.85 SSR Mb^–1。大部分重复基元为二至四核苷酸, 占76.91%,
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