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[目的]探究云南文山牛群体Y染色体遗传结构与血统来源,以期为该黄牛品种的资源保护与利用提供科学依据.[方法]研究采用PCR扩增和生物信息学方法,对55头文山牛Y-SNPs(UTY19和ZFY10)和Y-STRs(INRA189和BM861)遗传多样性进行系统研究.[结果]55头文山牛均属于瘤牛Y3单倍型组,结合Y-SNPs和Y-STRs分型结果,发现文山牛中存在Y3-88-156和Y3-90-156两种Y染色体单倍型,Y染色体单倍型多样度为0.1684±0.0636.[结论]云南文山牛只有瘤牛父系起源,其遗传血统稳定,纯合度高.