地被菊bHLH转录因子基因家族鉴定及其低温胁迫响应

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地被菊(Chrysanthemum morifolium)是菊科菊属多年生宿根草本植物,花型整齐,色彩多样,有较高的观赏价值.北方地区温度低,严重限制了地被菊的栽培范围.碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子家族广泛参与植物的生长发育和非生物胁迫响应.本研究以地被菊\'映洁\'为材料,根据转录组数据克隆了 17个CmbHLHs基因,ORF在603~1 242 bp之间,对蛋白理化性质进行预测分析发现,17个CmbHLHs蛋白中8个蛋白为酸性,9个蛋白为碱性,这些蛋白都定位在细胞核上.bHLH蛋白二级结构α-螺旋占比为25.49%~51.50%,β-转角占比为1.42%~5.88%;miRNA预测分析显示,9个miRNA可能调控8个CmbHLHs基因转录后的表达.利用MEME软件预测CmbHLH基序组成,共鉴定出6个保守基序,除CmbHLH8和CmbHLH15外,其他蛋白都包含基序1和基序2.系统发育分析显示,17个CmbHLHs基因分布于12个bHLH亚家族.低温处理地被菊幼苗,qPCR分析发现,7个CmbHLHs基因受到低温胁迫诱导后表达量增加.本研究可为地被菊bHLH基因功能的进一步研究提供参考.
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