广东省活禽市场外环境重配H3N2亚型禽流感病毒污染调查

来源 :中国病原生物学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiangshuhua
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目的 了解2017-2018年广东省活禽市场外环境中H3N2亚型禽流感病毒的污染和变异情况. 方法 于2017-2018年在广东省禽流感监测点采集环境样品进行核酸检测,阳性样品接种鸡胚分离病毒并进行全基因组测序,利用相关软件进行生物信息学分析. 结果 成功获得7株H3N2亚型禽流感病毒,其HA蛋白裂解位点序列均为PEKQTR↓ GL,与典型低致病性禽流感病毒的序列特征相符合.其中一分离株NS基因发生D92E干扰素抗性突变.HA蛋白受体结合位点、神经氨酸酶耐药位点、M基因上的金刚烷胺类药物耐药位点、PB2基因上与哺乳动物适应性相关位点等均未发生突变.系统进化分析显示,7株分离株的8个基因片段均处在欧亚禽源分支中,但相互间存在差距.结论 7株分离株中存在5种组合的重配H3N2亚型禽流感病毒,其中1株NS基因发生D92E干扰素抗性突变.因此应加强活禽市场及环境监测,防止产生能在人群中流行的重配H3N2病毒.
其他文献
目的 建立检测人呼吸道合胞病毒(human Respiratory Syncytial Virus,hRSV)实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)绝对定量检测法. 方法 提取人呼吸道合胞病