独行菜LaAP2基因克隆、生物信息学分析及表达分析

来源 :广西植物 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cypbvg
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
AP2/ERF是广泛存在于植物中一类重要的转录因子,调控一些参与非生物胁迫相关基因的表达,帮助植物提高逆境胁迫能力。为了深入探讨LaAP2在独行菜耐受低温萌发及幼苗耐受低温生长中的功能,该研究基于前期对独行菜(Lepidium apetalum)转录组数据库分析,克隆获得一个显著上调表达的AP2/ERF家族序列LaAP2。该基因cDNA全长为1 005 bp,编码氨基酸序列包含一个AP2和一个B3结构域,属于AP2/ERF转录因子RAV亚家族。推定的LaAP2蛋白分子量为37.744 67 kD,等电点为9.49。该蛋白氨基酸序列同亚麻荠、拟南芥、油菜等物种显示出较高同源性,系统进化分析结果表明与拟南芥亲缘关系较近。氨基酸序列分析预测表明,LaAP2基因所编码的蛋白不具备信号肽区段,无跨膜区,不属于分泌蛋白,可能为亲水性蛋白;定位于细胞质的可能性为56.5%,定位于细胞核的可能性为21.7%;其主要二级结构元件为无规则卷曲、延伸链、α-螺旋。Real-time PCR分析独行菜幼苗中LaAP2在低温4℃处理下的表达,显示LaAP2表达受低温胁迫呈先下降后升高趋势。这表明LaAP2在独行菜幼苗抵抗低温胁迫中起调控作用。
其他文献
单位要选派人下乡“锻炼”,别人都避唯恐之不及,他却两次主动请缨,2006年、2013年,先后担任村支部书记和镇党委副书记。从司法、城管到环保,学计算机出身的他初次接触到这些
《国有土地上房屋征收与补偿条例》将原有的行政强迁与司法强迁并行转变为统一的司法强迁,最高人民法院在此基础上又确立了裁定准许后主要由政府组织实施的执行模式。当前,法
<正>如果承认合同有效,那么就是在默认场外配资行为是合法的;如果认定合同无效,那么关于利息、违约金等约定均属无效,在一方不履行借贷合同的情况下,另一方的合同权益很难通
现阶段,高校重视学科建设等教育事业,但是对于财务收支的审计情况有所忽略,加强高校高校财务收支审计的研究,有助于高校经费使用的合理化。
文章通过作者在海外做国际贸易的亲身经历,形象的深层次的阐述了国际贸易的潜规则:用在一般的国际贸易实务的教材里看不到的具体案例对国际贸易的潜规则从六个方面做了详细透
发挥诗歌的美学特征以及美育的功能,在实际的教学中运用灵活的教学手段、方法,将美的观念和思想渗透给学生是语文教学的重要目标之一,这样也同样会达到促进学生全面发展的目
针对城市河流水体污染严重、水生态系统破坏加剧等突出问题,以南京市江宁区牛首山河为例,通过监测水质、浮游植物、底栖动物、重金属等指标的变化情况,选取了11项指标作为水
地震相干体技术是石油地球物理勘探的一项常用技术。本文首先对地震相干体技术进行简要说明,描述了五代相干算法的原理和特点,并通过编程实现了相关算法。通过模型试算,验证
针对某电站300MW燃煤锅炉,基于专门开发的CFX-TASCFLOW软件平台,将额定负荷下空气气氛、不同初始氧浓度φ(O2=21%、30%、35%、40%)的O2/CO2气氛,共五种工况下的炉内流动、燃
目的探讨综合干预措施对乙型肝炎病毒血清标志物(HBV-M)阳性的肺结核患者抗结核药物引起肝损伤的影响。方法选择2008年8月-2010年5月在本院住院的确诊为肺结核伴有HBV-M阳性
会议