依照股权集中度,将上市公司的国有股权结构划分为五种类型,由此研究了新会计准则实施后2007—2011年国有股权结构影响上市公司自主创新的程度和模式。方差分析和负二项回归模型的实证结果发现:国有股权结构对上市公司自主创新能力的影响在统计上是显著的;影响的积极或消极性与否、影响模式等依赖于国有股权的集中度,国有控股股权集中度与自主创新能力组成"倒U型"的关系,与国有参股企业共同形成整体上的"正N型"影响模式,由此最终分化为两种形式的治理结构,其一是国有控股企业股权区间集中性的治理结构,其二是国有参股企业市场竞争性的治理结构。因此,要进一步深化股权分置改革,合理调整国有股权在上市公司中的持股比例,完善股权制衡机制,促进上市公司自主创新模式的转变,提高上市公司自主创新能力。