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目的：探讨高职高专医学院校病例指导临床医学专业解剖学教学。方法：对我校2014级临床医学专业两个合班，共计276人进行分组试验。对学生理论考试成绩、技能考试成绩、学习能力等3个方面进行综合比较评价。结果：以临床常见疾病指导解剖学教学明显提高学生自主学习能力，提高了学生发现问题和解决问题的能力。结论：在高职高专医学院校中，以临床常见疾病指导解剖学教学有利于学生提高学习兴趣、学习能力等，有利于培养学生临床思维能力。