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基于DNA的复制子载体显著地提高了复制子载体的应用范围，在体外可用于高水平表达外源基因，大规模制备重组病毒颗粒，在体内可用于复制子疫苗和基因治疗载体研究．将复制子RNA的cDNA置于RNA聚合酶Ⅱ启动子和转录终止子控制下时，基于RNA的复制子载体可转变为基于DNA的复制子载体．当DNA载体转染细胞后，第一阶段，RNA聚合酶Ⅱ启动子在核内起始合成RNA，经过加工和修饰后运输到细胞质中，相当于复制子RNA，第二阶段，该RNA自我复制及表达外源基因，相当于病毒RNA复制循环．在成功地构建了基于DNA和RNA的双