背景与目的:选择性剪接是基因表达中的重要调控机制,异常的剪接可导致细胞周期异常、癌基因转录因子激活及抑癌基因转录因子失活;异常剪接与肿瘤发生、发展息息相关。DNA甲基化是表观遗传修饰的重要组成部分,基因启动子的异常甲基化可导致基因沉默,抑癌基因和DNA修复基因的高甲基化参与多种肿瘤的发生;另外DNA甲基化还是选择性剪接的关键参数,DNA异常甲基化影响选择性剪接的平衡。本研究通过对食管鳞癌组织标本中RBFOX1(RNA binding protein,fox-1 homolog 1)选择性剪接基因的甲基化水平和表达进行检测,探讨其临床应用价值。方法:在149例配对的食管鳞癌及癌旁组织中,运用Mass ARRAY对RBFOX1基因的甲基化水平进行检测,并从同一批样品中选取42对组织采用RT-PCR进行RBFOX1基因的mRNA表达分析,统计甲基化水平与食管鳞癌主要临床病理特征的关系。结果:在食管鳞癌组织标本中,RBFOX1的甲基化水平为41.8%,明显低于对应癌旁组织的68.3%。差异有统计学意义(P<0.01);RBFOX1的甲基化水平与患者的性别、年龄、吸烟、饮酒以及肿瘤的分化、分期等无明显相关。依据癌组织中甲基化水平阈值(33.6%)=Mean(癌旁组织)-2.5SD(标准差),将研究对象分为两组,低于阈值的一组定义为组1,高于阈值的为组2。组1和组2的5年总体生存率(overall survival,OS)为57.0%和35.7%。差异无统计学意义(P=0.06)。组1和组2的5年无进展生存率(progression-free survival,PFS)为48.7%和28.9%。差异有统计学意义(P=0.03)。多因素分析结果显示仅TNM分期为生存的独立预测因子。结论:选择性剪接基因RBFOX1在食管鳞癌组织中的甲基化水平和表达水平均低于癌旁组织,RBFOX1启动子区的甲基化水平不能作为生存分析的预测因子。