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采用因子分析法,利用SPSS13.0软件选取了7个指标,用以评价城市创新系统的创新能力,进而采用系统动力学方法,利用VensimPLE软件,以南京市为例建立理论模型。研究发现,教育投入、系统的创新效率、企业科技投入以及政府科技投入对城市创新产出影响显著,其中企业科技投入对创新产出影响大于政府科技投入对其的影响,据此给出了提高城市创新能力的途径。