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生态恢复是生态科学的最终实验，从种群角度看，恢复的目标是使种群（尤其是优势种或建群种）到具有生长、繁殖和适应进化变化的能力。要达到这个目标，种群遗传学知识必不可少。遗传变异是物种适应变化环境的基础，而局部适应则是种群适应局部环境遗传分化的结果，它们在生态恢复中起着重要的作用。分析了生态恢复过程中影响种群遗传变异因素，主要有取样误差和小种群效应（主要是瓶颈或建立者事件及其以后的近交和漂变等），在进行