明党参内生菌对苯磺隆的生物降解作用

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  关键词:明党参;内生菌;苯磺隆;降解率;生物学鉴定
  明党参(Changium smyrnioides Wolff)为我国特有的伞形科明党参属植物,别称山花、山萝卜、明参、明党[1]。明党参是草本植物,周围易杂草丛生,杂草与明党参植株竞争土壤中的营养成分,从而影响植株的生长发育,而磺酰脲类除草剂,如苯磺隆,能够有效去除其周围杂草,使明党参旺盛生长。
  苯磺隆(tribenuron-methyl,TBM),别称麦乐乐、苯磺隆、巨星(杜邦)、亿力、阔叶净、麦磺隆等,是20世纪80年代由美国杜邦公司开发的一种内吸传导型磺酰脲类麦田除草剂[2-5],主要用于防除各种一年生阔叶杂草。苯磺隆在我国长江、黄河和淮河流域有着广泛的使用范围。苯磺隆的大量使用,给土壤、水体、生物及大气等诸多环境因子造成大量污染,影响农业生产和生态平衡[6-8]。因此,解决苯磺隆的残留问题对改善除草剂对作物的药害,修复受除草剂污染的土地有重要的理论意义和实际价值。而在生态系统中,作为分解者的微生物,代谢类型多样,适应环境的能力极强,能利用各种人工合成的农药作为碳、氮源生长,并将其完全降解成无机物[9]。田爽等筛选出4株能以苯磺隆为唯一碳源生长的降解菌,并对其生理生化特性进行研究[9]。Zhang等筛选出一株苯磺隆降解菌,经初步鉴定为假单胞杆菌,根据所查资料,国外尚未见有关于降解苯磺隆菌株的研究报道[10]。本试验从明党参内生菌着手,进行一系列的研究,旨在从中筛选出能够高效降解苯磺隆的明党参内生菌株。
  1 材料与方法
  1.1 材料
  1.1.1 培养基 无机盐培养基(inorganic salt medium,IS):磷酸二氢钾(3.0 g/L)、七水硫酸镁(0.1 g/L)、硝酸铵(2.0 g/L)、磷酸氢二钾(1.5 g/L)、无水氯化钙(0.01 g/L)、乙二胺四乙酸二钠(0.01 g/L),pH值7.5±0.1,25 ℃。营养琼脂培养基(nutrient agar,NA):牛肉浸粉(3.0 g/L)、蛋白胨(10.0 g/L)、氯化钠(5.0 g/L)、琼脂粉(15.0 g/L),pH值7.3±0.1,25 ℃。
  1.1.2 试验样品与试剂 试验样品明党参产自河南省郑州市某中草药试验田。试验试剂:苯磺隆(纯度95%)由中国沈阳化工研究所提供;甲醇(色谱纯)由天津市科密欧化学试剂有限公司生产;乙腈(色谱纯)由天津市科密欧化学试剂有限公司生产。
  1.1.3 试验仪器和设备 一次性无菌进样器(1 mL):江苏华达医疗器材有限公司生产;紫外可见分光光度计(UV2600):日本岛津仪器有限公司生产;高效液相色谱仪(Agilent 1200):安捷伦科技有限公司生产;台式高速冷冻离心机(Allegra 64R):美国贝克曼库尔特有限公司生产。
  1.2 试验方法
  1.2.1 明党参内生菌的分离 取明党参的根、茎、叶等组织部位,将组织表面的泥土等杂质用自来水冲洗之后在干净的自来水中浸泡1 h;然后移入无菌超净工作台,用无菌水再次冲洗3次之后用无菌滤纸吸干表面的水分。采用“75%乙醇-2.5%次氯酸钠-75%乙醇”三步表面消毒法将各组织消毒,其中根组织用75%乙醇浸泡3 min,2.5%次氯酸钠浸泡7 min,75%乙醇浸泡20 min;茎组织用75%乙醇浸泡3 min,2.5%次氯酸钠浸泡5 min,75%乙醇浸泡18 min;叶组织用75%乙醇浸泡 2 min,2.5%次氯酸钠浸泡3 min,75%乙醇浸泡 15 min。表面消毒过的明党参组织,分别用无菌水冲洗6次后用无菌滤纸吸干表面的水分。之后用灭菌的镊子、剪刀、无菌刀片将明党参的根与叶组织剪切成0.5 cm×0.5 cm的小块,茎组织剪切成长度约为0.5 cm的组织。在NA、PDA、高氏一号培養基的平板上,分别等距接种4个根、茎、叶组织块,每个处理重复3次。将平板依次放置到37、28、30 ℃培养箱中,观察平板中组织边缘菌落生长状况。
  对照组:采用组织印迹法,将以上经过消毒处理的根、茎、叶组织放入NA、PDA、高氏一号培养基中,使灭菌材料表面与培养基接触20 min后移走明党参各组织块,并将培养基置于相同条件下培养相同时间,观察平板是否有肉眼可见的菌落长出。
  1.2.2 明党参内生细菌的纯化与保藏 待平板中组织块边缘长出可以用肉眼观察到的菌落后,用接种环挑取少许边缘菌落接种到新的NA培养基中,37 ℃恒温箱中倒置培养,待菌落生长后重复此操作6次以上进行纯化,直到得到单一的纯菌落。定期观察,挑选优势单菌落划线纯化后甘油保藏备用。
  1.2.3 苯磺隆降解菌的筛选 (1)初筛。将以上分离得到的明党参内生菌接种在NA培养基上进行活化,再转接到营养肉汤培养基中,37 ℃、150 r/min下培养12 h。配制无机盐固体培养基,121 ℃、0.1 MPa 下灭菌15 min。在超净工作台中,向无机盐培养基中加入等量的浓度为10%的苯磺隆溶液,倒平板,冷却。分别取1 mL菌液接种于无机盐培养基,无菌环境下涂布,37 ℃恒温培养箱进行培养。将得到的菌株接入NB培养基,37 ℃、150 r/min振荡培养1 d,向100 mL无机盐液体培养基中加入浓度为10%的苯磺隆溶液1 mL,取1 mL NB培养基中的菌液接种于无机盐液体培养基,37 ℃、150 r/min振荡培养,定时取样,于D600 nm测定菌株的生长情况,重复多次。(2)复筛。配制150 mL的无机盐液体培养基,121 ℃、0.1 MPa下灭菌15 min。在超净工作台中,向培养基加入苯磺隆标准品0.45 g,摇匀混合。将初筛得到的菌液接种于此,37 ℃、150 r/min 振荡培养,定时观察无机盐培养基的清晰程度,并定时取样,于D600 nm测定菌株的生长情况,重复多次。   1.2.4 高效降解苯磺隆的明党参内生菌的生物学鉴定 (1)形态学鉴定。将经过复筛得到的明党参内生细菌菌株接种于NA平板上,37 ℃条件下培养 1 d,观察其菌落形态并记录;挑取菌落边缘少量菌体进行革兰氏染色,电子显微镜下镜检并拍照。(2)分子生物学鉴定。①高效降解苯磺隆的明党参内生菌的16S rDNA基因序列同源性分析:提取明党参内生细菌的基因组DNA,然后进行PCR扩增,将PCR产物进行测序,并将测序结果进行DNA多序列比对,利用MEGA 7.0软件构建系统进化树,对菌株进行置信度分析。②高效降解苯磺隆的明党参内生菌的质谱分析:将内生细菌接种到NA平板上,37 ℃培养12 h后,按如下样品准备流程操作:在 1.5 mL 离心管中加入300 μL去离子水。挑取单菌落样本加入离心管中,充分振荡混匀。再加入 900 μL 无水乙醇,充分混匀。在室温12 000 r/min下离心4 min,倒去上清,再次离心,除去上清,40 ℃ 恒温干燥沉淀2 min。加入10 μL裂解液1,振荡混匀;加入同体积的裂解液2,充分混匀。在室温 12 000 r/min 下离心4 min。吸取1 μL上清液,滴加到样品靶板上,另任意选一靶点滴加1 μL质谱仪校准品,并在室温下晾干。晾干后,取1 μL基质溶液覆盖在上述样品点上,并在室温下晾干。将样品靶板放入质谱仪进行测定。
  1.2.5 苯磺隆降解率的测定 (1)紫外分光光度计法。配制50 mL的无机盐培养基,121 ℃、0.1 MPa 下灭菌15 min。向冷却后的每瓶培养基中加入0.15 g苯磺隆标准品,摇匀,取复筛得到的菌株菌液0.5 mL加入其中,每株菌重复3次,1瓶培养基不加菌株菌液(空白对照),37 ℃、150 r/min振荡培养。配制不同浓度的苯磺隆标准品溶液,通过苯磺隆全波长扫描,检测分析出苯磺隆的最佳吸收波长为245 nm。从每瓶培养液中取5 mL液体于离心管中,离心之后吸取上清液并加入5 mL二氯甲烷进行萃取,分液,取有机相进行旋蒸,加入甲醇进行溶解,用0.2 μm的过滤膜过滤之后,在245 nm处测苯磺隆的吸光度。(2)高效液相色谱法。将 0.3 g 苯磺隆标准品溶于1 000 mL的无菌水中,配制成浓度为0.03%的苯磺隆标准品溶液,充分溶解之后,取5 mL苯磺隆标准品溶液加入体积为45 mL的无机盐培养基中。吸取明党参内生菌降解苯磺隆的复筛菌液0.5 mL,分别加入无机盐培养基中,每组重复3次,1组不加菌液(对照)。37 ℃、150 r/min 振荡培养,每隔24 h,吸取2 mL苯磺隆降解液于试管中,再向其中加入2 mL的乙腈溶解降解液中的苯磺隆,用0.22 μm的有机过滤膜过滤,加入进样瓶中,制成待测的样品。
  2 结果与分析
  2.1 明党参内生菌的分离、筛选与纯化
  将新鲜的明党参植株的根、茎、叶经“三步消毒法”消毒后分别放置到NA、PDA、高氏一号平板中,在37、28、30 ℃培养一段时间得到明党参植株组织的内生菌。同时经对照组验证平板置于相同条件下培养相同时间,无菌落在对照组平板上生长,证明得到的菌落为明党参内生菌产生的。将明党参组织的内生菌经分离、纯化、对照组验证,根据平板中菌落初步特征(菌落大小、菌落颜色、菌落透明度、菌落边缘情况、是否凸起特征)初步分为29株。
  2.2 降解苯磺隆的明党参内生菌的筛选结果
  在含10%苯磺隆的固体无机盐培养基上接种的29株明党参内生细菌,在37 ℃恒温培养箱内经过连续多天的培养,只有8株菌生长,分别为NMY1、NMG9、NMJ10、PMG3、PMG4、NMG4、NMY4、NMG5。由表1可知,接种于含10%苯磺隆的固体无机盐培养基上的这8株菌数量大幅增加,长势良好,基本判断这8株菌能够以10%苯磺隆为唯一碳源、氮源生存,由此推断这8株菌能够降解苯磺隆。用紫外分光光度计检测,对照组培养液在245 nm时吸光度平均值为1.579,经过菌株PMG3降解后D245 nm为1.255,说明苯磺隆被降解了。將初筛选出的8株降解苯磺隆的明党参内生菌进行苯磺隆的富集驯化培养,筛选出1株能高效降解苯磺隆的菌株PMG3。
  2.3 苯磺隆的降解率
  在高效液相色谱仪Agilent 1200进行操作,色谱柱选用Promesil C18-BIO色谱柱(4.6 mm×250 mm,5 mm),对对照进行参数校正,流速确定为0.8 mL/min,柱温为30 ℃,检测波长为245 nm,进样量10 μL,进样时间15 min,流动相确定为水 ∶ 乙腈为30 ∶ 70,苯磺隆对照峰与溶剂峰分开,苯磺隆的出峰时间在3.1 min左右,出峰完整且清晰可见,见图1。随着苯磺隆浓度增加,其出峰时间会相对拖后。配制质量浓度不同的苯磺隆溶液,通过高效液相色谱分析的方法,以质量为横坐标,峰面积为纵坐标,作苯磺隆的标准曲线(图2),得出苯磺隆的标准曲线方程为y=4 536.300x-71.652,r2=0.999 6,用于估算苯磺隆的浓度。
  试验测得菌株降解苯磺隆的样品的色谱峰的峰面积值,根据图2苯磺隆标准曲线,计算10 μL中苯磺隆的含量,估算出菌株的降解率。对照组苯磺隆的质量浓度为0.03 mg/mL,经过菌株降解之后,发现在第1天(24 h)时降解效率最高,在第3天(72 h)时降解率可以达到89%以上,其中菌株PMG3降解3 d后,苯磺隆的含量最高为 3.296 μg/mL,最低可达到2.882 μg/mL,降解率达89%(表2)。通过初步试验筛选出菌株PMG3为高效降解苯磺隆的菌株,但后期的大量推广应用,还需进一步研究。
  2.4 降解菌的生物学鉴定
  2.4.1 降解菌的形态学鉴定 把明党参内生细菌菌株PMG3接种到NA平板上培养24 h,其平板中菌落形态和显微镜镜检图见图3。菌株PMG3在NA平板上生长时菌落为不规则圆,有凸起,呈现白色,菌落湿润,半透明,大小为5~6 mm,在显微镜下观察发现,PMG3菌体为长杆状,芽孢柱状,两端钝圆,长度较长,革兰氏染色为紫色,为革兰氏阳性菌株。   2.4.2 降解菌的16S rDNA基因序列同源性分析 经过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳、纯化回收DNA目的条带、PCR引物测序,菌株PMG3的16S rDNA基因序列全长为1 418 bp。选取与内生菌菌株同源性较高的10株菌株的16S rDNA基因序列构建系统发育进化树,结果见图4。通过BLAST同源性比对,结果表明,菌株PMG3与Bacterium wsb-1和Bacillus tequilensis stain Y11进化距离较近;结合菌株形态特征、生化特性、微生物质谱鉴定结果和16S rDNA基因序列同源性分析,初步鉴定菌株PMG3为芽孢杆菌属(Bacillus sp. PMG3)。
  2.4.3 降解菌的质谱分析 本试验所用的质谱仪基本原理是基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术[11],根据离子的质荷比与离子的飞行时间成正比,检测样品到达检测器的飞行时间即可检测离子,对样品进行分析,通过与数据库信息比对,筛选并确定相应图谱,进而得到鉴定结果,从而实现对不同细菌属、种的鉴定。菌株PMG3的质谱图谱如图5所示,菌株PMG3在4 307.89 m/z附近离子流强度最大, 其峰高为1 600, 峰面积为2 789 635,信噪比为28,分辨率为753。菌株PMG3经检索后与数据库中枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)的匹配分值为9.115,菌株PMG3鉴定为芽孢杆菌属。
  3 讨论与结论
  苯磺隆是一种乙酰羟基酸合成酶(AHAs)抑制除草剂[12]。AHAs又称乙酰乳酸合酶,催化支链氨基酸合成途径的第一步,包括缬草碱、亮氨酸和异亮氨酸[13-14]。苯磺隆通过将AHAs活性位点转变为难以与底物结合的构象来抑制杂草。目前,国内外关于苯磺隆的研究主要集中在药理、残留分析方法及其对植物生理特性的影响等方面[6-7,15-23]。虽然在苯磺隆的筛选、鉴定等方面已有一些文献报道,如田爽等筛选出4株能降解苯磺隆的菌株[9]。Zhang等筛选出2株苯磺隆降解菌,但很少涉及苯磺隆降解试验及降解率指标,所报道降解菌的降解效率不明晰,且菌源多为土壤[10]。杜迅等的试验菌源来自河南省临颍县麦田[24],田爽等的试验菌源来自受农药苯磺隆污染的土壤[9]。
  本研究首次以中草药明党参为菌源材料,分离得到了1株能够高效降解苯磺隆(降解率接近 89.07%)的内生菌,并对能高效降解苯磺隆的明党参内生细菌进行生物学鉴定,根据16S rDNA基因序列同源性分析以及质谱结果确定属于芽孢杆菌属,这与已有文献多数报道的降解菌不同,丰富了苯磺隆降解菌资源库,对于修复受苯磺隆污染的农田有着重要意义,也为中草药内生菌资源利用及农药生物降解菌的筛选开辟了新途径。
  苯磺隆作为磺酰脲类除草剂的一员,沸点较低,并且国内外对其报道都相对较少,再加上试验条件和试验时间所迫,本研究还存在一定的不足。今后可以在苯磺隆的降解条件、降解机理等方面進行探讨和研究,为中草药内生菌降解苯磺隆提供理论依据。
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