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连续流装置与气体同位素比值质谱计联用，已应用于众多领域，在自动进样器配合下，能批量完成样品前处理和数据采集工作。因实验条件一致，连续流的数据重现性不亚于双路进样（计制样误差）；但因样品信号随含量变化，不像双路进样系统那样，能始终保持样品气与参考气在相同条件下测试，所以，连续流的同位素比值或δ值时，更易受分馏效应影响。