【摘 要】
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探讨应用分子模拟与对接技术预测抗脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)单域重链抗体(DONIV2)的三维结构及其与DON的结合模式。采用生物信息学相关工具和网站分析预测DONIV2的理化特性及其二
【机 构】
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南昌大学食品科学与技术国家重点实验室,南昌大学中德联合研究院,南昌大佳科技有限公司
【基金项目】
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食品科学与技术国家重点实验室目标导向资助项目(SKLF-MB-201002), 国家中小企业创新基金项目(09C26213604449), 江西省教育厅青年科学基金项目(GJJ09442)
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探讨应用分子模拟与对接技术预测抗脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)单域重链抗体(DONIV2)的三维结构及其与DON的结合模式。采用生物信息学相关工具和网站分析预测DONIV2的理化特性及其二级结构,同源建模方法获得三级结构,然后采用分子对接软件Autodock 4.2将三维结构模型与DON进行分子对接。二级结构和三级结构分析显示,DONIV2由10个β片层结构组成,CDR区为无规则卷曲结构,位于分子的一端,在CDR1、CDR2与CDR3之间形成1条宽度约为1.2 nm的凹槽结构。对接结果显示,可能的DON结合
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