【摘 要】
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目的筛选肺鳞状细胞癌(LUSC)中受甲基化调控的基因,并分析其临床意义。方法从癌症和肿瘤基因图谱数据库中,下载338例LUSC组织和38例正常肺组织mRNA测序数据及DNA甲基化数据。
【基金项目】
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国家自然科学基金(81402306,81360312);广西自然科学基金(2018GXNSFAA281211)
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目的筛选肺鳞状细胞癌(LUSC)中受甲基化调控的基因,并分析其临床意义。方法从癌症和肿瘤基因图谱数据库中,下载338例LUSC组织和38例正常肺组织mRNA测序数据及DNA甲基化数据。采用R语言软件处理mRNA表达数据,筛选出差异表达基因(DEG),再运用受试者工作特征(ROC)曲线评估DEG鉴别LUSC组织和正常肺组织的效能,筛选出候选基因。使用minfi软件包分析TCGA数据库中甲基化数据,筛选出差异甲基化位点。利用MEXPRESS数据可视化工具,分析候选基因表达与其启动子区域DNA甲基化位点之间的相
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