【摘 要】
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目的 基于线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)与核糖体18S小亚基(18S rRNA)基因序列,分析确定4种肉食螨合适的DNA条形码,从而进一步完善肉食螨DNA条形码数据库.方法 2018年5
【机 构】
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皖南医学院医学卫生检验与检疫学教研室 芜湖241002
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目的 基于线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)与核糖体18S小亚基(18S rRNA)基因序列,分析确定4种肉食螨合适的DNA条形码,从而进一步完善肉食螨DNA条形码数据库.方法 2018年5月-2019年7月于安徽省阜阳、芜湖、铜陵等3市小型面粉作坊采集分离肉食螨样本,经形态学鉴定后,提取单个螨基因组DNA,经PCR扩增、克隆和测序获得COⅠ与18S rRNA基因序列,所获序列进行BLAST比对.结合已报道肉食螨序列,用ClustalX 1.83软件进行多序列比对,基于MEGA X软件进行序列分析并计算遗传距离,采用最大似然法构建系统发育树.结果 马六甲肉食螨、转开肉食螨、鳞翅触足螨分子鉴定结果与形态学一致,而GenBank中缺少网真扇毛螨相关序列.4种肉食螨COⅠ与18S rRNA基因序列(A+T)分别为69.6％和55.1％,碱基替换数分别为137对和46对.基于COⅠ与18S rRNA基因序列变异位点分析,发现4种肉食螨种间变异位点分别为154～ 321个和58 ～ 99个.4种肉食螨COⅠ与18S rRNA基因序列种内遗传距离均≤0.020,种间遗传距离分别为0.235 ～ 0.583和0.078 ～ 0.114.基于COⅠ与18S rRNA基因序列的系统发育树显示,4种肉食螨均能各自聚为一支,支持率均达100％,与形态学鉴定结果一致.结论 线粒体COⅠ基因序列作为4种肉食螨DNA条形码优于18S rRNA基因序列,更适用于探索肉食螨的属、种低阶元亲缘关系.
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