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文章以中国国境口岸卫生检疫信息化系统建设需求为背景,针对现有系统存在的数据采集手段少、防控体系覆盖弱以及监测机制时效差等问题,提出并构建国境口岸传染病检疫决策支援系统,可用于海港、陆路、空港和铁路等各种类型口岸疫情防控。系统引入云计算SaaS模式整合了医学巡查、体温监测和旅客自主申报等疫情采集方式,优化了旅客卫生检疫业务流程实现方法;构建了传染病疫情监测三级实验室网络防控体系,并与国家质检总局、地方卫生系统及旅客来源地形成联防联控机制;采用大数据Hadoop分析技术及时搜集并掌握传染病的发展动态,口岸现场指导疫情排查并辅助领导决策。最后以深圳口岸试运行为例,探讨了该系统的可行性和有效性。