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在云南富民、砚山、邱北和南涧等云南主要辣椒产区采集了28个病毒样品，选择应用RT-PCR，MspⅠ以及EcoRⅠ酶切和克隆测序等分子生物学手段对其中的7种进行检测。经过RT-PCR实验确定其病原为黄瓜花叶病毒（CMV），同时分离物的MspⅠ酶切图谱与CMV亚组Ⅰ的酶切图谱很相似，经EcoRⅠ酶切后也没有出现异常差异。进一步对所检测的黄瓜花叶病毒分离物的外壳蛋白基因进行克隆测序，结果表明，分离物的核苷酸序列与黄瓜花叶病毒亚组Ⅰ的分离物的核苷酸序列有极高的同源性，达93％-98％；而与亚组Ⅱ株系的核苷酪南列同