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台湾地区斑马鱼研究起始于1996年，在经历了约8年的萌芽期（1996-2003年）之后，目前已进入到茁壮期（2004-现今），现今全台湾共有83个实验室使用斑马鱼作为实验材料，台湾地区斑马鱼研究社群的研究主题可大致分成3大类：（1）胚胎发育；（2）人类疾病；（3）生物技术。累积至今与斑马鱼相关论文发表总数已达到342篇。自2010年起，台湾也成立了两个斑马鱼种质资源库（TZCAS与ZeTH）。在种质资源库的充分协助下，目前许多医院的临床医师、工程与生物信息相关领域的研究人员，也开始加入斑马鱼研究社群进行跨