【摘 要】
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目的了解陕西株庚型肝炎病毒(HGV,RNA/GBV-C)的核苷酸序列特点. 方法从陕西省西安市两位非甲、乙、丙、丁、戊型肝炎患者的血清中,应用反转录及套式PCR技术,从血清中提取RNA,
【机 构】
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第四军医大学预防医学系流行病学教研室,陕西,西安,710033
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目的了解陕西株庚型肝炎病毒(HGV,RNA/GBV-C)的核苷酸序列特点. 方法从陕西省西安市两位非甲、乙、丙、丁、戊型肝炎患者的血清中,应用反转录及套式PCR技术,从血清中提取RNA,经特异性的反转录引物P4反转录成cDNA, 以此为模板分别用P3, P4及P1, P2两对引物进行PCR扩增,扩增到218 bp 的HGV RNA NS3区部分基因,将其克隆入PinPointTM Xal-T载体,挑选阳性克隆并进行了序列分析. 结果 SG2与HGV的核苷酸同源性分别为85.64%与84.48%;与GBV-C的核苷酸同源性为86.21%与84.48%,其二者之间同源性为97.13%;二者与HGV的氨基酸同源性分别为98.28%和93.10%,与GBV-C的氨基酸同源性也为98.28%,93.10%,二者之间的氨基酸同源性达94.83%. 结论庚型肝炎病毒NS3区核苷酸同源性较高,同义突变率也较高,可能是一个对其生存环境较为适应的病毒.
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