目的分析甲磺酸伊马替尼治疗中晚期高危胃肠间质瘤的疗效和安全性。方法回顾2008年10月—2014年10月到武汉商职医院诊治的中晚期高危胃肠间质瘤患者共96例,根据甲磺酸伊马替尼治疗时间分为两组,观察组48例患者治疗时间≥3年,对照组48例患者治疗时间<3年,比较两组患者疗效。结果观察组患者1、2、3、4、5年无进展生存率均明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。性别、年龄和治疗时间是影响甲磺酸伊马替尼治疗有效率的重要因素(P<0.05)。治疗后观察组患者血清基质金属蛋白酶-9(MMP-9)蛋白及蛋白酶激活受体(PAR-2)mRNA水平均明显低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。治疗期间两组患者血细胞减少、肝肾功能受损、胃肠道反应、乏力及皮肤黏膜水肿等不良反应发生率均未表现出明显差异。结论延长甲磺酸伊马替尼治疗时间至3年以上能够有效提高中晚期高危胃肠间质瘤患者无进展生存率,且不良反应发生率并未明显升高,安全性好,建议临床推广应用。