【摘 要】
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为鉴定禽源多杀性巴氏杆菌(Pm)链霉素(Str)敏感株与耐药株(MIC=1024μg/mL)在转录组水平上的差异,本研究采用RNA-seq技术对Str敏感株与耐药株进行双向测序,筛选得到差异表达基因,通
【机 构】
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湖北省农业科学院畜牧兽医研究所,长江大学动物科学学院,农业部畜禽细菌病防治制剂创制重点实验室
【基金项目】
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公益性农业行业科研专项:家禽主要细菌病防控技术研究与示范(201303040);现代农业产业技术体系建设专项资金资助(CARS-42-G11);规模化养鸡场主要疫病防控关键技术研究(2015ABA039)
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为鉴定禽源多杀性巴氏杆菌(Pm)链霉素(Str)敏感株与耐药株(MIC=1024μg/mL)在转录组水平上的差异,本研究采用RNA-seq技术对Str敏感株与耐药株进行双向测序,筛选得到差异表达基因,通过GO、KEGG和ARDB数据库对差异表达基因进行分组和富集性分析,并利用荧光定量PCR对筛选出的差异表达基因进行验证。结果显示,共筛选获得625个差异表达基因,其中包括581个上调基因和44个下调基因。通过GO功能富集分析显示差异表达基因多数发挥细胞膜转运功能;对差异表达基因进行信号通路富集性分析显示,大
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