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蛋白质关系网络的研究在生物医学领域中已成为一个热点。研究者通过对蛋白质关系网络进行分析和聚类，能够发现其中的复合体，进一步理解细胞组织原理。在对关系网络进行分析的过程中，将网络拓扑显示为图形，以直观地表示出关系网络的结构，便于对比聚类方法，辅助关系网络的研究。利用网络建模与可视化工具包JUNG设计并实现了一个蛋白质关系网络可视化系统，它能够解析多种格式的蛋白质关系网络数据，集成了几种有效的图聚类算法，并实现了一种基于蛋白质功能标注的发现复合体的聚类算法。用户能够通过二维网络视图方便地观察原始网络和聚类后的