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药物对神经系统的影响很常见。许多药物都有潜在的神经系统的不良反应。在1997年英国药物安全委员会收到的药物不良反应（ADR）中，18％涉及神经系统。药物引起的神经系统不良反应可能酷似某种疾病，且难以从神经系统疾病的病因学上确定哪种药物所起的作用。一些神经系统的疾病可能因为药物的使用而加重或诱发。如青霉胺可以引起重症肌无力，而氨基糖苷类可以使之恶化。