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新疆正处于大开发、大建设的跨越式发展时期，生态环境保护与建设和脱贫解困的矛盾日益凸显。新疆区域生态功能重要性及生态环境条件差别较大，决定了必须实施有差异的生态补偿政策。根据区域经济发展和生态环境状况，确定生态补偿优先序，分区规划，探索分类补偿政策，建立健全生态补偿机制，建设“美丽新疆”，是“稳疆兴疆，富民固边”战略目标和“生态立区”发展理念的内在体现，也是新一轮西部大开发中要着力解决的重大现实问题。