优化我国科技结构，加快构建以企业为科研项目出题人、掌舵人和答题人及各创新主体相互协同的创新联合体，是提升企业创新能力的核心，更是有效突破关键核心技术“卡脖子”难题的关键。围绕“强化企业创新主体地位”，通过量化研究和国际对比发现，我国企业已成为“创新主体”仅是表象，强化我国企业的创新主体地位迫在眉睫。高等院校在我国科技结构中占有优势，平衡企业和高校的科技资源分配，重视产学合作将是优化我国科技结构的关键。试行企业和科研院所的战略组合，可成为一条企业迅速成为创新主体的新路径。为促进企业成为创新主体，政府应让战略型企业家发挥更大的作用，赋予领军企业参与所在行业的高等院校、科研院所建设发展的权利，并对企业在财政、税收等方面加大支持力度。对企业自身而言，其应具有明确的创新发展战略和完善的组织体系，不断提高科技创新投入，加快科技创新水平提升，发挥创新引领带动作用。