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张志聪诠释《神农本草经》,阐明药性和药用,总以"五运六气"之理和"格物取象用药"为视角,认为万物各有自然之性,即当有其自然之性理,可原其始终,于外在气化环境及药物本身自然形气中探求。具体方法是:穷天地之气化、原其所由生成;格物于自然,"述类象形"以辨药。因形不违气、外内相通之故,二者各行其径,又时而交互贯通。