【摘 要】
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目的:探究基于GMrepo数据库背景下,健康对照、腺瘤患者、腺癌患者肠道菌群多样性改变规律,为肠道菌群与结直肠癌的发生机制研究提实验室证据。方法:GMrepo分析健康对照、腺瘤患者、腺癌患者肠道菌群丰度改变,并筛选出腺瘤癌变过程中丰度变化较大的菌群。收集35例结直肠腺瘤患者粪便,提取DNA进行宏基因组测序,建立文库。用MetaPhlAn与HUMAnN生信分析软件对菌群丰度进行分析与功能注释。数据处理与统计分析采用宏基因组学分析软件LEfSe7、STAMP8、QIIME9和R数据包。结果:GMrepo分析健
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(No.81973533,No.81560454)。
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目的:探究基于GMrepo数据库背景下,健康对照、腺瘤患者、腺癌患者肠道菌群多样性改变规律,为肠道菌群与结直肠癌的发生机制研究提实验室证据。方法:GMrepo分析健康对照、腺瘤患者、腺癌患者肠道菌群丰度改变,并筛选出腺瘤癌变过程中丰度变化较大的菌群。收集35例结直肠腺瘤患者粪便,提取DNA进行宏基因组测序,建立文库。用MetaPhlAn与HUMAnN生信分析软件对菌群丰度进行分析与功能注释。数据处理与统计分析采用宏基因组学分析软件LEfSe7、STAMP8、QIIME9和R数据包。结果:GMrepo分析健
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