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通过高等学校科研绩效综合评价方法研究和综合评价工程实施,有助于完善科研绩效定量评价的方法体系,有助于加强研究型大学的科研绩效管理,也将为实现教育资源优化配置,促进高等教育实现可持续发展提供参考和依据。文章选取部分985工程高校为研究对象,应用Malmqusit指数方法实证测算了高校科研动态绩效。从强化高校财力资源的外部审计、建立基于科研绩效的激励机制、优化高校科研产出绩效的导向等方面提出了提高高校科研绩效的政策建议。