【摘 要】
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为了探究养殖红鳍东方鲀肠组织和胃组织在主要功能上的差异性,本研究选择一龄红鳍东方鲀通过转录组测序方法,比较肠和胃2种组织在基因表达上的差异性.研究分析发现:在胃组织中测出的碱基数均大于4.89×107 bp,在肠组织中测出的碱基数均大于5.42×107 bp.在肠相对胃(SA13 vs IA13)的比较中共获得3564个差异表达基因,其中2167个上调表达,1397个下调表达.在GO富集结果中的酶调节活动、细胞骨架结合、跨膜转运蛋白活性等功能存在显著富集.在KEGG的富集分析中发现大量与代谢有关的通路存在
【机 构】
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大连海洋大学水产与生命学院,辽宁大连 116023
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为了探究养殖红鳍东方鲀肠组织和胃组织在主要功能上的差异性,本研究选择一龄红鳍东方鲀通过转录组测序方法,比较肠和胃2种组织在基因表达上的差异性.研究分析发现:在胃组织中测出的碱基数均大于4.89×107 bp,在肠组织中测出的碱基数均大于5.42×107 bp.在肠相对胃(SA13 vs IA13)的比较中共获得3564个差异表达基因,其中2167个上调表达,1397个下调表达.在GO富集结果中的酶调节活动、细胞骨架结合、跨膜转运蛋白活性等功能存在显著富集.在KEGG的富集分析中发现大量与代谢有关的通路存在显著富集,这些代谢通路中大多数的差异基因在肠中表达量高于胃,呈下调表达.此外在粘着连接、紧密连接、细胞粘附分子等通路中也存在显著富集,而其中大多数的基因呈上调表达.研究中筛选到6个差异表达基因并通过RT-qPCR方法进行验证,验证结果与转录组测序结果保持一致.研究结果为今后养殖红鳍东方鲀饵料选择和提高饵料系数提供思路,也为其他生物肠道基因的研究提供参考.
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