陆地棉果胶甲酯酶GhPME6的克隆及功能分析

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结合陆地棉SSH-cDNA文库的测序结果,与棉花EST数据库进行序列比对和分析,获得1条在棉纤维次生壁加厚期特异表达的EST序列,该序列编码果胶甲酯酶(PME).利用RACE技术获得其全长 cDNA序列,命名为GhPME6.基因结构分析表明,GhPME6包含1个长度为1560 bp的开放阅读框、2个外显子和1个内含子,编码含有519个氨基酸的蛋白.其氨基酸序列具有PMEI和Pectinesterase两个保守结构域通过对不同棉属基因组中的PME6基因进行比对分析,发现PME6在进化过程中具有高度保守性.qRT-PCR分析显示,GhPME6在纤维发育次生壁加厚期大量表达,推测该基因可能对棉纤维比强度有重要影响.构建GhPME6基因的大肠杆菌表达体系,获得与预期大小一致的目的蛋白,为深入研究GhPME6对棉纤维比强度的影响奠定了基础.
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