【摘 要】
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A组肠道病毒(Enterovirus A,EV-A)是手足口病的主要病原体。基因组流行病学将基因组技术与生物信息学和流行病学有机整合,可快速对致病病原体进行鉴定和溯源。基因重组是肠道
【机 构】
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中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒资源中心,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所脊髓灰质炎室
【基金项目】
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“十三五”国家科技重大专项(项目号:2017ZX10104001),题目:基于全基因组的病毒网络化监测和溯源技术体系研究;“十三五”国家科技重大专项(项目号:2018ZX10711001),题目:病毒感染高通量快速检测与应急筛检技术研究~~
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A组肠道病毒(Enterovirus A,EV-A)是手足口病的主要病原体。基因组流行病学将基因组技术与生物信息学和流行病学有机整合,可快速对致病病原体进行鉴定和溯源。基因重组是肠道病毒进化的驱动力之一。本研究以EV-A的基因组为研究对象,对其进行重组特点分析,为基于EV-A基因组的手足口病病原体溯源技术体系提供基础资料。本研究以GenBank中全部1 180条EV-A的全长基因组序列为研究对象,为降低序列的冗余性和减少计算强度,对序列进行整理,剔除核苷酸相似性>98%的序列,构建包含346条EV-
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