【摘 要】
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目的分析流感疫苗应答过程中抗体谱的发育成熟特征，为后续抗体研发提供理论依据。方法基于三价灭活流感疫苗(trivalent influenza vaccine，TIV)刺激后的时序性抗体重链测序数据，从抗体突变程度、互补决定区3(complementary-determining region 3，CDR3)氨基酸特征、VDJ基因使用方面分析疫苗应答过程中抗体谱的发育成熟特征。结果疫苗刺激后抗体的突
【机 构】
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200092 上海同济大学生命科学与技术学院生物信息学系,200092 上海同济大学生命科学与技术学院生物信息学系,200092 上海同济大学生命科学与技术学院生物信息学系,200092 上海同济大学
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目的分析流感疫苗应答过程中抗体谱的发育成熟特征，为后续抗体研发提供理论依据。
方法基于三价灭活流感疫苗(trivalent influenza vaccine，TIV)刺激后的时序性抗体重链测序数据，从抗体突变程度、互补决定区3(complementary-determining region 3，CDR3)氨基酸特征、VDJ基因使用方面分析疫苗应答过程中抗体谱的发育成熟特征。
结果疫苗刺激后抗体的突变频率显著提高。CDR3的特征分析显示，带电荷氨基酸和芳香族氨基酸的使用频率较高；原始B细胞(naive B cell)中CDR3长度服从正态分布，而疫苗刺激后，15～18个氨基酸长度的CDR3序列形成主导地位。另外，免疫前后VDJ基因的使用发生明显变化，带有抗体重链胚系基因IGHV3-7的抗体序列对疫苗具有显著应答；免疫后第7天应答最为强烈，随着时间的增加应答强度逐渐减弱。
结论疫苗刺激下，抗体谱动态进化以产生特异性应答的抗体，从序列层面分析应答特征有助于衡量免疫应答的有效性。
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