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本文对花椒不同居群的rDNA ITS区序列片段进行了测定和分析.rDNA ITS区序列片段有603 bp、GC百分比为60.3%.在所比较的花椒居群中,ITS区序列片段存在着22个变异位点.依据花椒rDNA ITS区的碱基差异,我们可以有效鉴别陕西凤县凤椒、甘肃武都大红袍、甘肃文县枸椒等花椒居群.