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目的：建立食管癌EC109细胞CDNA微矩阵基因芯片，并对其可靠性进行验证。方法：提取正常食管上皮细胞和EC109细胞的mRNA，逆转录得CDNA，再逆转录得CRNA，用Cy3-duTP标记EC109细胞CRNA，用Cy5-duTP标记正常食管上皮细胞CRNA，制备表达谱探针，利用该探针对EC109细胞与正常食管上皮细胞进行杂交。荧光扫描基因芯片，筛选表达谱。利用自身比较实验、重复实验和R^2、一致率（C冠）及假阳性率（即冠）等指标对该基因芯片系统进行方法学分析。结果：该基因芯片系统2次实验结果的符合率达