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分子系统学研究表明云南分布的鸡，以菌为一个自然单系群，臧穆命名的华鸡[土从]菌属真菌与鸡[土从]菌属其他真菌有较密切的亲缘关系；根据ITS序列建立的亲缘关系可以将云南产鸡[土从]菌属真菌划分为以下6个分支：（1）海姆鸡[土从]菌、乳头盖鸡[土从]菌和空柄鸡[土从]菌；（2）黑根鸡[土从]菌；（3）烟灰鸡[土从]菌、云南鸡[土从]菌和真根鸡拟菌；（4）条纹鸡[土从]菌、灰褐条纹鸡[土从]菌和炭黑条纹鸡[土从]菌；（5）小果鸡[土从]菌；（6）端圆鸡[土从]菌．