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蒙库铁矿床位于西伯利亚板块的阿尔泰活动陆缘麦兹晚古生代陆内裂谷盆地,并产于该盆地北东缘的中部,即麦兹倒转紧闭复式向斜的北东倒转翼中部.容矿地层为下泥盆统康布铁堡组的下亚组,铁矿体严格受NW走向的铁木下尔滚次级紧闭向斜构造控制,并产于向斜构造的核部.控矿断层可能是由铁木下尔滚次级紧闭向斜和巴寨区域性断裂联合作用产生的次级断裂构造.蒙库铁矿床的赋矿围岩主要为前进区域变质作用产生的角闪更长片麻岩,局部可见断裂混合岩化现象.近矿围岩蚀变甚弱,主要表现为夕卡岩化作用,出现了石榴子石、绿帘石、钙铁辉石、透闪石等夕卡岩