【摘 要】
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蛋白质二级结构预测是空间结构预测的关键步骤,β-转角是蛋白质二级结构中的重要类型之一,因此,找到一种准确预测不同类型β-转角的方法,对于建立蛋白质三维空间结构有重要意
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(30960090)
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蛋白质二级结构预测是空间结构预测的关键步骤,β-转角是蛋白质二级结构中的重要类型之一,因此,找到一种准确预测不同类型β-转角的方法,对于建立蛋白质三维空间结构有重要意义。本文构建了一个含有2878条蛋白质链的数据库,比目前普遍使用的含有426条蛋白质链的数据库扩大了6倍多。以矩阵打分值、离散增量值、相似性值和预测的二级结构信息作为组合向量输入到支持向量机中,对不同β-转角进行了预测,各类的预测总精度均大于92.8%,MCC值均大于0.285。
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