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目的探讨不同方法在手足口患者病原检测中的效果对比分析，为该病的病原检测提供依据。方法标本为2010年1月-10月在我院所采集的手足口患者及幼儿园健康幼儿的粪便标本共164份。采用RT-PCR和荧光探针PCR方法检测病人和正常人群粪便标本，并对结果进行对比分析。结果Real—PCR方法检出86例阳性，阳性率为52．44％，RT—PCR检出64份阳性，阳性率为39．02％。两组间的差异具有统计学意义（P〈0．05）。结论荧光PCR技术，能大大减少扩增产物污染的机会，与RT-PCR技术相比，具有较高的准确率。