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2017年4月调查衢山岛附近海域水质、沉积物质量和生态环境质量,大面调查评价结果表明水质监测中无机氮、活性磷酸盐和锌含量部分站位超标,活性磷酸盐含量超标是影响海水水质的主要因素。沉积物监测中,石油类、有机碳、硫化物、铜、铅、锌、镉、铬、汞、砷的含量均达标。浮游植物、浮游动物和潮间带生物种类丰富而底栖生物种类较为单一。