柚FIE同源基因的克隆及表达分析

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FIE基因在受精前抑制胚乳发育并在受精后通过特异位点阻碍胚发育相关基因的转录.在拟南芥中,FIE突变最终导致种子败育.本研究从马家柚中克隆到1个FIE同源基因,开放阅读框(ORF)长为1110bp,编码369个氨基酸,命名为CmFIE (GenBank: IDMG680456),包含一个保守的WD40 motif结构域.推测其蛋白分子质量为41.443 3 kD,等电点为6.02,属于不稳定亲水性蛋白,并以折叠结构和环状结构为主.系统进化树分析表明,与甜橙(Citrus sinensis CsFIE亲缘关系最近.qRT-PCR分析显示,CmFIE基因在马家柚种子和幼苗根、茎、叶中均有表达,但在种子中的表达量相对更高.CmFIE在正常种子中的发育过程持续表达,并在授粉后4~7周(胚乳细胞化之前和开始时)表达量下降,另外胚乳退化型败育种子中CmFIE表达水平被发现从授粉2周后开始一直高于正常种子.结果 表明CmFIE对种子发育起到重要的调控作用,这与模式植物拟南芥FIE基因的功能一致.通过探究柚FIE基因生物信息学特性及在种子中的表达情况,可以为FIE基因在种子发育过程中的功能研究提供理论基础.
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