目的:对新疆哈萨克族食管鳞癌组织及癌旁组织长链非编码RNA(lncRNA)表达谱进行分析,并探讨其与食管癌发生和发展的关系.方法:采用基因芯片技术,对4组食管鳞癌及其癌旁组织中差异表达的lncRNA进行筛选,通过lncRNA-mRNA共表达网络对靶基因进行预测,利用GO和KEGG数据库进行富集分析和通路分析,明确lncRNA的功能.结果:癌组织和癌旁组织之间差异表达的lncRNA共318个,与癌旁组织比较,癌组织中193个lncRNA表达上调,125个lncRNA表达下调(P<0.01).富集分析表明共有5个GO类别,其中细胞成分有3个,生物过程有1个,分子功能有1个,均通过反式调控方式调控靶基因.通路分析表明这些差异表达的基因可能参与轴突导向信号通路和ECM受体相互作用途径信号通路.结论:新疆哈萨克族食管鳞癌组织中lncRNA的表达水平与癌旁组织有明显差异,差异表达的lncRNA可能参与食管癌的复杂调控网络,并与肿瘤发生和发展有一定的关系.