【摘 要】
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目的:建立Illumina Miseq深度测序筛查酸奶中微生物的方法,分析酸奶中微生物的多样性。方法:以9种酸奶样品为研究对象,提取酸奶中细菌基因组DNA,应用高通量测序技术测定细菌
【机 构】
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安徽出入境检验检疫局技术中心; 合肥工业大学食品科学与工程学院; 上海出入境检验检疫局;
【基金项目】
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长三角地区功能性微生态制剂关键检测技术及溯源体系的开发应用(1503062007);长三角地区微生态制剂关键检测技术及溯源体系的开发应用(14495810200)
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目的:建立Illumina Miseq深度测序筛查酸奶中微生物的方法,分析酸奶中微生物的多样性。方法:以9种酸奶样品为研究对象,提取酸奶中细菌基因组DNA,应用高通量测序技术测定细菌的16S r DNA v1-v3变异区序列,得到9种样品中微生物群体分布和丰度、以及不同样品间的菌种差异与进化关系。结果:酸奶中微生物主要为厚壁菌门(Firmicutes),占据99.6%之高,其中厚壁菌门主要以链球菌属(Streptococcus、87.1%)、乳杆菌属(Lactobacillus、10.3%)、乳球菌属(Lactococcus、0.3%)组成,9种酸奶中有3种同时含有链球菌属和乳杆菌属,其余6种样品中链球菌属几乎占据全部(>97%)。结论:Illumina Miseq深度测序技术可快速精确深入掌握酸奶中微生物多样性,结果对比显示不同酸奶菌种同质化程度高,其中链球菌属占绝对优势,同时发现部分酸奶标签标示不符。
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