【摘 要】
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应用网络药理学及分子对接技术探究参麦注射液治疗心房纤颤(以下简称“房颤”)的活性成分及分子机制.通过TCMSP及TCMID数据库搜集参麦注射液中单味药的化学成分,借助PubChem数据库得到规范化学成分名称和PubChem CID(以下简称CID),经SwissADME数据库筛选得到活性成分后利用SwissTargetPrediction数据库进行靶点预测;通过GeneCards、OMIM等数据库搜集到房颤治疗相关靶点;利用Venny 2.1构建韦恩图并得到交集靶点.使用Cytoscape软件构建单味药-
【机 构】
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西安交通大学第二附属医院心血管内科,陕西西安710004;西北工业大学生命学院,陕西西安710072
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应用网络药理学及分子对接技术探究参麦注射液治疗心房纤颤(以下简称“房颤”)的活性成分及分子机制.通过TCMSP及TCMID数据库搜集参麦注射液中单味药的化学成分,借助PubChem数据库得到规范化学成分名称和PubChem CID(以下简称CID),经SwissADME数据库筛选得到活性成分后利用SwissTargetPrediction数据库进行靶点预测;通过GeneCards、OMIM等数据库搜集到房颤治疗相关靶点;利用Venny 2.1构建韦恩图并得到交集靶点.使用Cytoscape软件构建单味药-活性成分-潜在作用靶点网络;利用clusterProfiler R功能包对交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;依据STRING数据库生成交集靶点的蛋白与蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,以Cytoscape软件可视化分析后找出关键(hub)靶蛋白,再将其与反向筛选的活性成分进行分子对接.结果 显示参麦注射液的活性成分65个及对应靶点681个,2798个与房颤治疗相关靶点,交集靶点235个,共涉及GO功能2549个,通路153条;PPI网络经可视化分析,最终筛选出hub靶蛋白丝/苏氨酸蛋白激酶1(RAC-alpha serine/threonine-protein kinase,AKT1)、磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(phosphatidylinositol-4,5-bisphos-phate 3-kinase catalytic subunit alpha,PIK3CA)、雌激素受体1(estrogen receptor 1,ESR1),将其与反向筛选的39个活性成分进行分子对接,对接活性较高的有30个活性成分.其中,麦冬高异黄酮类CID 10871974、CID 5319742、CID 10361149与AKT1的结合活性较好.该研究初步表明,参麦注射液通过多成分、多靶点、多通路作用于房颤,其中麦冬高异黄酮类是其重要活性成分,主要通过作用于AKT1调控代谢、炎症、细胞凋亡等途径治疗房颤.
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