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[目的]确证簇毛麦属（Dasypyrum）与偃麦草属（Thinopyrum）物种不同基因组的系统发生关系。[方法]采用ISSR引物对12个小麦族物种扩增后进行了聚类分析。[结果]多年生簇毛麦（D.breviaristatum）、中间偃麦草（Th.intermedium）和二倍体长穗偃麦草（Lo-phopyrum elongatum）亲缘关系最近而聚在一起,而二倍体簇毛麦（D.villosum）与拟鹅观草（Pseduoroengeria spicata）聚在一起。[结论]多年生簇毛麦Vb基因组与偃麦草E基因