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在中枢神经系统中，氧气，二氧化碳和一些基本营养物质可以通过血脑屏障，而其他血液组分和大分子蛋白则不能通过。卒中、脑创伤等均可破坏血脑屏障完整性，使血清白蛋白之类的大分子通过血脑屏障进入脑组织间隙。脑血管病变时，中枢神经系统中的血源性丝氨酸蛋白酶，如凝血酶、组织纤维蛋白溶酶原激活剂和纤溶酶等的出现很有意义。目前发现丝氨酸蛋白酶类与胶质瘢痕形成、水肿、癫痫发作和神经组织坏死等过程相关。