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区域创新与产业集群由于存在着地域、结构、功能和目标等多项关联,因此两者存在着必然联系和相互影响。在对国内外产业集群与区域创新理论回顾的基础上,分析了区域创新系统面临的困境。构建了基于产业集群的区域创新系统分析模型,该模型包括知识应用与扩散子系统、知识产生与发散子系统和区域政策子系统。最后对基于产业集群的区域创新策略选择提出了建议。