【摘 要】
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为了分析细菌16S rRNA基因可变区与其全长序列之间进化关系的相似性,对核糖体数据库项目(RDP)所提供的细菌16S rRNA基因进行了研究.在对可变区进行截取、筛选等数据预处理后,对可变区实际碱基数目和操作分类单元数目进行了统计分析.结果显示,V2、V3、V4可变区,特别是V2、V4可变区,不仅在序列长度上较长,实际碱基数目也大大超过其他可变区,较其他可变区包含更多的序列信息;建立了层次距离矩阵算法,计算出V2、V3、V4可变区与全长序列所构建的进化树之间的距离差异值分别为59052、87154、45
【机 构】
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郑州大学信息工程学院 河南郑州 450001;郑州大学第一附属医院 河南郑州 450052;河南省人民医院口腔医学中心 河南郑州 450003
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为了分析细菌16S rRNA基因可变区与其全长序列之间进化关系的相似性,对核糖体数据库项目(RDP)所提供的细菌16S rRNA基因进行了研究.在对可变区进行截取、筛选等数据预处理后,对可变区实际碱基数目和操作分类单元数目进行了统计分析.结果显示,V2、V3、V4可变区,特别是V2、V4可变区,不仅在序列长度上较长,实际碱基数目也大大超过其他可变区,较其他可变区包含更多的序列信息;建立了层次距离矩阵算法,计算出V2、V3、V4可变区与全长序列所构建的进化树之间的距离差异值分别为59052、87154、45848,可见V4可变区在进化关系上更接近全长序列,使用V4可变区构建进化树的可信度要优于V2、V3可变区,且层次距离矩阵算法比一些传统的距离与相似度算法具有更好的性能.
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急性早幼粒细胞白血病(acute promyelocytic leukemia ,APL)是一种特殊类型的急性髓细胞性白血病,占同期急性骨髓性白血病的10％ ～15％[1-2 ].其发病机制是 15 号和17 号染色体易位 t (15;17 ) (q24;q21 )形成早幼粒细胞白血病-维甲酸受体( promyelocytic leukemia-retinoic acid receptor , PML-RARα)融合基因而导致粒细胞分化受阻、而异常早幼粒细胞大量增殖[3-6].APL 伴嗜碱性粒细胞增多的
滤子理论在多值逻辑及其相关代数的研究中起到了非常重要的作用.为进一步研究非交换剩余格上的滤子理论,基于非交换剩余格上模糊滤子的定义,在非交换剩余格上引入模糊PMTL滤子的概念,给出了这类模糊滤子的一系列刻画,并进一步提出非交换剩余格上模糊同余和模糊商代数的定义,证明了由模糊PMTL滤子生成的模糊商代数是伪MTL代数.
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传统的约束马尔可夫决策过程(constrained Markov decision process,CMDP)模型用来解决多目标决策的困难,但该模型缺乏通用性并且只适用于离散环境.为了解决这一问题,提出一种基于CMDP的改进算法CRODP,与强化学习(reinforcement learning,RL)算法结合,将带约束问题建模为拉格朗日公式,其中包含着深度强化学习的策略参数.然后进一步推导出模型参数的更新公式,并将其作为深度强化学习神经网络的损失函数.模型在学习过程中动态调整约束与主要目标之间的权重以确
甲状腺癌是最常见的内分泌肿瘤,也是近30年来发病率上升最快的肿瘤[1-2 ].甲状腺髓样癌(medullary thyroid carcinoma ,MTC)在甲状腺恶性肿瘤中比较少见,仅占所有甲状腺癌的3％ ～4％,甲状腺髓样癌颅内转移病例国内外更是鲜有报道[3 ].2019年,我科收治了1例甲状腺髓样癌颅内转移患者,现汇报如下并复习相关文献.
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目的:研究长链非编码RNA CASC2在肝癌中的表达及其临床意义,并探讨其作用机制.方法:采用RT-PCR检测42例肝癌患者肿瘤组织中CASC2的表达水平,分析CASC2表达对肝癌患者各临床病理参数和预后的影响.通过细胞转染建立CASC2过表达的肝癌细胞系,采用CCK-8法检测各组细胞的增殖活性,T ransw ell法检测细胞迁移和侵袭能力.双荧光素酶实验验证CASC2与miR-221的相互作用.并采用RT-PCR检测各组细胞和肝癌组织中miR-221的表达水平.在CASC2组细胞中过表达miR-221