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克隆胚胎发育率太低和后代缺陷率高是克隆不能广泛应用于畜牧生产和生物医药的最大障碍。影响克隆效率的因素很多，过去20多年主要集中于改进和完善核移植程序方面。完善NT程序是成功克隆条件之一，但卵母细胞和供体细胞质量同样会影响胚胎的发育率和胎儿出生率。卵母细胞是一种特殊而复杂的细胞，能使供体细胞核重新程序化，其质量不一也是造成体细胞克隆结果不稳定的原因之一。